Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnfsf9P41274 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms