Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms