Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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