Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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