Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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H2-Eb1P04230 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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H2-Eb1P04230 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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H2-Eb1P04230 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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H2-Eb1P04230 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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