Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms