Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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