Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms