Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm3550W4VSN7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm3550W4VSN7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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