Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm4T1NXB5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms