Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm26992S4R1A3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.7 ms