Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcniQ9Z2V9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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