Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms