Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd4Q9Z2D7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms