Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms