Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms