Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip6Q9Z1Y4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms