Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syngr4Q9Z1L2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms