Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ror1Q9Z139 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ror1Q9Z139 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms