Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NgfrQ9Z0W1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms