Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms