Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms