Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms