Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnip1Q9WUU8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnip1Q9WUU8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnip1Q9WUU8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnip1Q9WUU8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnip1Q9WUU8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnip1Q9WUU8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnip1Q9WUU8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnip1Q9WUU8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnip1Q9WUU8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnip1Q9WUU8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms