Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms