Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU62

Incenp, Inner centromere protein, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IncenpQ9WU62 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IncenpQ9WU62 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IncenpQ9WU62 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms