Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pfdn5Q9WU28 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pfdn5Q9WU28 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pfdn5Q9WU28 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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