Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms