Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 777 ms