Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms