Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma1Q9R1P4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms