Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc26a4Q9R155 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc26a4Q9R155 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms