Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms