Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms