Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms