Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms