Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CtsjQ9R014 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsjQ9R014 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms