Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms