Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms