Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM0

Ubqln2, Ubiquilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln2Q9QZM0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubqln2Q9QZM0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln2Q9QZM0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms