Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms