Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms