Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms