Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms