Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms