Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lsm4Q9QXA5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms