Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dpf1Q9QX66 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dpf1Q9QX66 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dpf1Q9QX66 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dpf1Q9QX66 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dpf1Q9QX66 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dpf1Q9QX66 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dpf1Q9QX66 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dpf1Q9QX66 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Dpf1Q9QX66 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dpf1Q9QX66 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dpf1Q9QX66 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dpf1Q9QX66 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms