Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc5Q9QX29 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms