Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms