Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms